成果名稱：WSSV病毒microRNA對對蝦細(xì)胞自噬的影響研究

研發(fā)人員：吳文林   

所屬領(lǐng)域：生物醫(yī)學(xué)

完成單位：泉州師范學(xué)院

項目簡介：

1  建立了對蝦自噬研究模型。

2 獲得了對蝦自噬誘導(dǎo)后基因表達(dá)變化的數(shù)據(jù)庫。采用對蝦轉(zhuǎn)錄組測序分析，提取對照組和自噬誘導(dǎo)組對蝦的RNA，分析自噬誘導(dǎo)條件下對蝦基因轉(zhuǎn)錄變化。結(jié)果發(fā)現(xiàn)了3050個基因的表達(dá)出現(xiàn)變化，其中自噬誘導(dǎo)條件下1456個基因表達(dá)上調(diào)，1594個基因表達(dá)下調(diào)。通過差異表達(dá)基因的聚類分析、GO功能富集、KEGG注釋、KEGG通路富集分析等手段，分析這些差異表達(dá)基因與細(xì)胞代謝、環(huán)境應(yīng)激等過程的關(guān)系，為找到對蝦自噬相關(guān)基因及其cDNA序列奠定了良好基礎(chǔ)。

3 獲得了WSSV感染后對蝦miRNA的表達(dá)譜并發(fā)現(xiàn)和鑒定了新的miRNA分子。對WSSV感染對蝦和健康對蝦的miRNA測序結(jié)果進(jìn)行分析，共預(yù)測出59 個miRNA，其中已知miRNA 5 個，新預(yù)測miRNA 54 個。對這59個microRNA的表達(dá)譜的分析發(fā)現(xiàn)，當(dāng)對蝦被WSSV感染后，有8個miRNA的表達(dá)上調(diào)。

4 獲得了52個來源于WSSV的miRNA分子及其序列。對這52個miRNA的功能開展研究，分析其與細(xì)胞自噬作用的關(guān)系，有利于揭示WSSV感染對細(xì)胞自噬的影響，促進(jìn)我們對WSSV病毒感染機(jī)制的了解。