福建省海洋藻類(lèi)活性物質(zhì)制備與功能開(kāi)發(fā)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、泉州師范學(xué)院海洋與食品學(xué)院在近岸沉積物中可培養(yǎng)放線菌資源獲取方面取得新成果。研究結(jié)果以“A simple culture method enhances the recovery of culturable actinobacteria from coastal sediments(一種簡(jiǎn)單的提高近岸沉積物中可培養(yǎng)放線菌資源的培養(yǎng)方法)”為題目,發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《Frontiers in Microbiology》(期刊2區(qū),Journal IF=4.2)。
圖1. 利用4種培養(yǎng)基從泉州灣3個(gè)典型生境沉積物中分離得到的放線菌類(lèi)群
放線菌(Actinobacteria)是一類(lèi)好氧,高G+C含量的革蘭氏染色陽(yáng)性細(xì)菌。因放線菌能產(chǎn)生豐富多樣的次級(jí)活性代謝產(chǎn)物而備受關(guān)注,如抗生素、酶制劑等。近岸沉積物中蘊(yùn)含著豐富的海洋微生物資源,是人類(lèi)開(kāi)發(fā)利用的寶貴財(cái)富。然而絕大多數(shù)的微生物仍然未培養(yǎng)(uncultivated)。那么如何獲取微生物資源是人們一直關(guān)注的重點(diǎn)問(wèn)題。
本研究從2018年10月開(kāi)始,利用一種用純水提取沉積物營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)制作培養(yǎng)基(簡(jiǎn)稱(chēng)為WEM),從泉州灣近岸3個(gè)典型生境(互花米草生長(zhǎng)區(qū)、牡蠣養(yǎng)殖區(qū)、洛陽(yáng)紅樹(shù)林保護(hù)區(qū))沉積物樣品開(kāi)展微生物的分離培養(yǎng)、鑒定及保藏工作。結(jié)合另外3種培養(yǎng)基(MB、MEM、SCA),共分離保藏1000多株細(xì)菌,可分為390個(gè)基因型。其中約4%菌株為潛在新種或者新屬,有待于分類(lèi)鑒定。分離的放線菌類(lèi)群共138株,分布在6個(gè)目、24個(gè)屬,62個(gè)基因型;用SCA、MB及MEM共分離得到31株,25株、2株放線菌,而用WEM分離到80株,分布在5個(gè)目,14個(gè)屬,42個(gè)基因型,顯著提高了放線菌類(lèi)群的分離(圖1)。通過(guò)可培養(yǎng)類(lèi)群與MiSeq16S擴(kuò)增子獲得細(xì)菌類(lèi)群的進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)泉州灣近岸沉積物微生物資源非常豐富,并且絕大多數(shù)的放線菌類(lèi)群仍未培養(yǎng),為后續(xù)放線菌資源的開(kāi)發(fā)利用提供支撐。
泉州師范學(xué)院海洋與食品學(xué)院、福建省海洋藻類(lèi)活性物質(zhì)制備與功能開(kāi)發(fā)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室為第一單位,海洋微生物的分離培養(yǎng)與鑒定工作主要由16級(jí)海洋技術(shù)、17級(jí)海洋技術(shù)10位本科生共同參與完成。本研究得到自然資源部第三海洋研究所海洋微生物菌種保藏中心支撐項(xiàng)目(2019KJ25) 及福建省科技廳自然科學(xué)基金項(xiàng)目 (2020J01789)資助。(黃兆斌 供稿)